A Coleção de Microrganismos de Interesse para a Agricultura da Embrapa Soja (CMES) tem por principal objetivo preservar patógenos (fungos, vírus e bactérias) de importância para a cultura da soja e microrganismos com potencial para controle biológico desses fitopatógenos. A coleção contém também patógenos associados às culturas do trigo, do girassol e de algumas plantas daninhas. Patógenos de plantas daninhas podem ter potencial para controle dessas plantas.