A coleção Herpetológica Bertha Lutz (CHBL) teve inicio em 2013. A coleção abriga anfíbios (adultos e girinos) e répteis em via líquida. A coleção está organizada em armário de ferro, os espécimes estão acondicionados em potes e separados por espécie e no caso dos girinos, separado por lotes. A coleção atualmente tem exemplares principalmente do Paraná, Santa Catarina, São Paulo, Minas Gerais, Espírito Santo e Goiás. Todos os exemplares estão numerados individualmente, e atualmente estamos com pouco mais de 2.000 exemplares na coleção.  A Coleção Herpetológica Bertha Lutz tem por finalidade subsidiar pesquisas científicas, principalmente as realizada pelos estudantes da UNILA. A coleção também oferece oportunidades para o desenvolvimento de estágios voluntários. Associada à CHBL, há também uma coleção de tecidos provenientes de parte dos espécimes tombados, destinada a estudos genéticos e moleculares.